Permasalahan yang dihadapi dalam pengelolaan persampahan mencakup :

1. Timbulan sampah makin besar

- Jumlah populasi terus bertambah (alami/urbanisasi)
- Meningkatnya kemampuan ekonomi, produksi dan konsumtivitas
- Peran masyarakat dan dunia usaha sangat rendah dalam upaya minimalisasi sampah

2. Kapasitas pelayanan terbatas

- Paradigma lama pengelolaan sampah mengandalkan proses (kumpul-angkut-buang)
- Prioritas pendanaan sangat rendah dan tidak sebanding dengan kebutuhan pelayanan
- Kapasitas kelembagaan belum memadai (status, kewenangan, perencanaan, pengawasan, SDM, dll)
- Kinerja operasional pelayanan belum memenuhi standar pelayanan minimal

3. Kapasitas masyarakat dan swasta sebagai mitra belum dibangun dan dikembangkan

- Perhatian untuk sosialisasi, pembinaan, pendidikan, masyarakat sangat rendah
- Iklim dan birokrasi kemitraan belum kondusif dan menarik bagi swasta untuk berinvestasi